Direct antagonisme
Bij direct antagonisme is de antagonist in staat stoffen te produceren die plantpathogenen remmen. Sommige antagonisten zijn in staat antibiotica tegen bacteriën of schimmels te produceren en op die manier de groei en voortplanting van de ziekteverwekkers te beïnvloeden. Andere secundaire metabolieten (stoffen die niet direct betrokken zijn bij de groei van cellen, bij de ontwikkeling of bij de reproductie van de plant) van antagonisten die effect hebben op plantpathogenen zijn bijvoorbeeld lipopeptiden of vluchtige stoffen die groei en activiteit van een pathogeen kunnen remmen zonder dat de antagonist heel dichtbij de ziekteverwekker hoeft te komen. Onder andere verschillende soorten pseudomonas-, bacillus- en streptomyces bacteriën produceren veel antibacteriële en/of antischimmel antibiotica en vluchtige stoffen.